Universitas Proklamasi 45 Yogyakarta melaksanakan Audit Mutu Internal (AMI), Audit ini dilakukan pada program studi Teknik Industri yang bertujuan untuk memastikan bahwa semua program dan kegiatan akademik serta non-akademik berjalan sesuai dengan standar kualitas yang telah ditetapkan. Audit Mutu Internal ini merupakan bagian dari upaya berkelanjutan Universitas untuk meningkatkan kualitas pendidikan dan layanan yang diberikan kepada mahasiswa dan seluruh pemangku kepentingan.